mNGS 助力治疗一例多发脓肿的混合感染
摘要
病史摘要:患者 63 岁男性,既往有糖尿病病史 10 余年,未规律治疗;多次“肝脓肿”手术史; 大量嗜酒史。因“发热、气促伴胸痛 1 天”入院,入院后诊断肺脓肿、肝脓肿、重症肺炎、感染性休克。入院 后血培养提示高毒力肺炎克雷伯杆菌,根据细菌药敏积极抗感染治疗后患者病情仍持续恶化,完善 mNGS 检查 提示星座链球菌感染。考虑肺炎克雷伯杆菌及星座链球菌联合混合性感染导致患者多发脓肿形成。 症状体征:患者入院时高热、气促、胸痛。入院后反复寒战、高热、气促,神志清楚,面色苍白,口唇轻 度紫绀。全身皮肤及黏膜未见明显瘀斑瘀点。两肺呼吸运动对称,语音震颤未及增强及减弱。双肺呼吸音粗, 未闻及干湿啰音;心脏及腹部查体无阳性体征。末梢紫绀,双下肢无水肿。 诊断方法:患者因高热伴呼吸困难入院,胸部 CT 提示双肺实变影及多发空腔形成,白细胞、中性粒细 胞、降钙素原(PCT)、C 反应蛋白(CRP)等感染指标异常,双侧血培养结果诊断为高毒力肺炎克雷伯杆菌。 mNGS 检测结果提示星座链球菌。 治疗方法:入院后根据血培养药敏结果先后给予亚胺培南西司他汀、美罗培南、替加环素及磷霉素等抗感 染治疗,患者病情未见明显好转,期间予气管插管、机械通气,经完善 mNGS 检测结果提示星座链球菌感染, 经验性给予万古霉素联合美罗培南抗感染,同时辅以严格控制血糖、增强免疫力、血管活性药物、纠正电解质、 肠内外营养支持以及早期康复等对症支持治疗。 临床转归:治愈。参考
[1]Gu W,Miller S,Chiu CY.Clinical Metagenomic
Next-Generation Sequencing for Pathogen Detection.
Annu Rev Pathol.2019 Jan 24;14:319-338.doi:10.1146/
annurev-pathmechdis-012418-012751.Epub 2018 Oct
24.PMID:30355154;PMCID:PMC6345613.
[2]Miller S,Naccache SN,Samayoa E,Messacar
K,Arevalo S,Federman S,Stryke D,Pham E,Fung B,Bolosky
WJ,Ingebrigtsen D,Lorizio W,Paff SM,Leake JA,Pesano
R,DeBiasi R,Dominguez S,Chiu CY.Laboratory validation
of a clinical metagenomic sequencing assay for[3]pathogen
detection in cerebrospinal fluid.Genome Res.2019
May;29(5):831-842.
[3]Goldberg B,Sichtig H,Geyer C,Ledeboer
N,Weinstock GM.Making the Leap from Research
Laboratory to Clinic:Challenges and Opportunities for
Next-Generation Sequencing in Infectious Disease
Diagnostics.mBio.2015 Dec 8;6(6):e01888-15.
[4]Wilson MR,Sample HA,Zorn KC,Arevalo S,Yu
G,Neuhaus J,Federman S,Stryke D,Briggs B,Langelier
C,Berger A,Douglas V,Josephson SA,Chow FC,Fulton
BD,DeRisi JL,Gelfand JM,Naccache SN,Bender J,Dien
Bard J,Murkey J,Carlson M,Vespa PM,Vijayan T,Allyn
PR,Campeau S,Humphries RM,Klausner JD,Ganzon
CD,Memar F,Ocampo NA,Zimmermann LL,Cohen
SH,Polage CR,DeBiasi RL,Haller B,Dallas R,Maron
G,Hayden R,Messacar K,Dominguez SR,Miller S,Chiu
CY.Clinical Metagenomic Sequencing for Diagnosis
of Meningitis and Encephalitis.N Engl J Med.2019 Jun
13;380(24):2327-2340.
[5]Simner PJ,Miller S,Carroll KC.Understanding the
Promises and Hurdles of Metagenomic Next-Generation
Sequencing as a Diagnostic Tool for Infectious Diseases.
Clin Infect Dis.2018 Feb 10;66(5):778-788.
[6]Brown JR,Bharucha T,Breuer J.Encephalitis
diagnosis using metagenomics:application of next
generation sequencing for undiagnosed cases.J Infect.2018
Mar;76(3):225-240.
[7]Dulanto Chiang A,Dekker JP.From the Pipeline
to the Bedside:Advances and Challenges in Clinical
Metagenomics.J Infect Dis.2020 Mar 28;221(Suppl
3):S331-S340.
[8] 北京市临床检验中心 , 北京医学会检验医学分
会 , 首都医科大学临床检验诊断学系 , 等 . 高通量测序
技术临床检测规范化应用北京专家共识 ( 第一版通用
部分 )[J]. 中华医学杂志 ,2019,99(43):3393‐3397.
[9] 宏基因组学测序技术在中重症感染中的临床
应用共识专家组 , 中国研究型医院学会脓毒症与休克
专业委员会 , 中国微生物学会微生物毒素专业委员会 ,
等 . 宏基因组学测序技术在中重症感染中的临床应用
专家共识 ( 第一版 )[J]. 中华危重病急救医学 ,2020,32(5):
531‐536.
[10]Lee RA,Al Dhaheri F,Pollock NR,Sharma
TS.Assessment of the Clinical Utility of Plasma
Metagenomic Next-Generation Sequencing in a
Pediatric Hospital Population.J Clin Microbiol.2020 Jun
24;58(7):e00419-20.
[11] 缪青 , 胡必杰 , 陈翔等.一种基于病原宏基因
二代测序的解读方法 ,cn110335656A[p].2019.
[12] 中华医学会细菌感染与耐药防治分会.呼吸
系统感染中宏基因组测序技术临床应用与结果解读专
家共识 [J]. 中华临床感染病杂志 ,2022,1(2):90-102.
[13] 中华医学会检验医学分会临床微生物学组中
华医学会微生物学与免疫学分会临床微生物学组中国
医疗保健国际交流促进会临床微生物与感染分会 . 宏
基因组高通量测序技术应用于感染性疾病病原检测中
国专家共识 [J]. 中华检验医学杂志 ,2021,44(2):107-120.
[14]Maitre T,Ok V,Calin R,et al.Pyogenic lung
abscess in an infectious disease unit:a 20-year
r e t r o s p e c t i v e s t u d y [ J ] . T h e r A d v R e s p i r
Dis,2021,15:17534666211003012.
[15]Capitaine A,Woerther PL,Auzou M,
et al.Paradoxical High-Level spiramycin resistance
and erythromycin susceptibility due to 23S rRNA
mutation in streptococcus constellatus[J].Microb Drug
R esist,2020,26(7):727-731.
[16] 李承俊 , 陈智利 , 林元相 , 等 . 星座链球菌致
基底节区脑脓肿 1 例并文献复习 [J]. 临床神经外科杂
志 ,2021,18(04):462-464.
[17] 崔世超 , 于文成 , 石莹 . 星座链球菌感染导致
脓胸 1 例 [J]. 青岛大学医学院学报 ,2013,49(04):341.
[18]Noguchi S,Yatera K,Kawanami T,et al.The
clinical features of respiratory infections caused by
the Streptococcus anginosus group[J].BMC Pulm
Med,2015,15:133.DOI:10.1186/s12890‑015-0128-6.
[19]Porta G,Rodríguez‑Carballeira M,Gómez L,et
al.Thoracic infection caused by Streptococcus milleri[J].Eur
Respir J,1998,12(2):357‑362.
[20]Palaniappan S,MacWalter RS,Winter JH,et
al.Empyema of lung associated with Streptococcus milleri
infection[J].Scott Med J,2000,45(5):153‑154.
[21]Okada F,Ono A,Ando Y,et al.High‑resolution
CT findings in Streptococcus milleri pulmonary infection.
[J].Clin Radiol,2013,68(6):e331‑e337.
[22]Rams TE,Feik D,Mortensen JE,et al.Antibiotic
susceptibility of periodontal Streptococcus constellatus
and Streptococcus intermedius clinic isolates[J].Periodont
ol,2014,85(12):1792-1798.
[23]Elhussein TA,Hutchison SJ.Streptococcus
constellatus community acquired pneumonia with
subsequent isolated pulmonic valve endocarditis and abscess
formation in a structurally normal heart[J].J Cardiovasc
Ultrasound,2014,22(2):91-94.
[24]Vayne C,Guéry EA,Rollin J,et al.Pathophy
siology and Diagnosis of Drug-Induced Immune
Thrombocytopenia[J].J Clin Med,2020,9(7):2212.Published
2020 Jul 13.