网络药理学合并分子对接术对三棱治疗白血病的潜在分子机制研究
摘要
目的 探讨三棱有效生物活性成分对白血病治疗潜在的机制研究。方法 采用中药药理学分析平台数据库系统获取 三棱活性成分及其对应靶点蛋白,借助 UniProt、PubMed 数据库查询活性成分对应的靶点蛋白基因名,采用 Cytoscape3.8.1 软件构化合物 - 靶点网络图。通过 DisGeNET 数据库查询与白血病相关的基因,借助 Bioinformatics & Evolutionary Genomics 平台筛选三棱活性成分靶点与白血病疾病靶点的交集基因,利用 STRING 数据库构建其蛋白 - 蛋白相互作用(PPI) 网络;利用 STRING 和 DAVID 生物信息学 KEGG 通路富集分析和数据库进行基因本体(GO)分析。采用 Autodock 软 件对三棱的有效活性成分与核心蛋白基因进行分子对接。结果 经筛选共获得具有开发药物的三棱活性成分 5 个、靶点蛋 白 658 个。三棱活性成分靶点与白血病疾病靶点的交集基因共 33 个。GO 分析结果显示,GO 条目 28 个 P < 0.01),主要 涉及细胞过程化学反应、细胞生物调节、细胞应激、氮化合物代谢过程、高分子代谢过程、信号传导、细胞凋亡。KEGG 通路富集分析显示,三棱有效成分主要影响的通路包括肿瘤坏死因子信号通路、小细胞肺癌、钙通道、MAPK 信号通路、 PI3K-Akt 信号通路等。三棱的有效活性成分与核心基因 PTGS2、SIRT1、 JUN、IL4、MAPK14 有较强的结合能力。结论 三棱中的活性成分可能通过 IL-17 信号通路、甲状腺激素信号通路、MAPK、PI3K-Akt 信号通路作用于 PTGS2、SIRT1、 JUN、IL4、MAPK14 等靶点作用于白血病,为进一步研究三棱治疗白血病的药理学及作用机制提供理论依据。参考
[1] 苏慧敏,王羽,李宏伟 . 询证护理应用于白血病化
疗患者的临床效果 [J]. 中国城乡企业卫生,2021,239(9):
143-145.
[2]GONG D, LI W, HU L D,et al. Clinical features and
prognosis of t (8; 21 )AML patients in China: a multicenter
retrospective study [J]. J Exp Hematol, 2017, 25(4):980-986.
[3] 张利强,陈振萍,郑杰 . 国产甲磺酸伊马替尼治疗
儿童慢性髓系白血病慢性期的早期疗效和安全性分析 [J]. 首
都医科大学学报,2019,40(2):174-178.
[4] 黄体龙,李曾丽,桑宝华,等 . BCL2 - 938C>A 基
因多态性与儿童急性淋巴细胞白血病危险度的相关性研究
[J]. 重庆医学,2019,48(11):1836-1839.
[5] 张石生 , 雷超 , 王洁等 . 基于数据挖掘中药治疗
急 性 髓 系 白 血 病 用 药 规 律 分 析 [J]. 辽 宁 中 医 药 大 学 学
报 ,2022,24(11):73-76.
[6] 张磊 , 程健 , 余莹 , 等 . 活血祛瘀药对三棱 - 莪术治
疗胃癌的网络药理学作用机制研究 [J]. 浙江中医药大学学
报 ,2020,44(08):773-782.
[7] 赵航 , 戴玮 . 三棱莪术组方辅助治疗胃癌的临床效果
研究 [J]. 癌症进展,2019,17(08):925-928.
[8] 王振兴 , 李水芹 , 赵梓亦 , 等 . 三棱、莪术提取物联
合热疗对结肠癌 SW620细胞凋亡及迁移、侵袭能力的影响[J].
中国药房 ,2018,29(24):3386-3391.
[9] 安娜 , 张古英 , 赵宜乐等 . 基于数据挖掘的中医药治
疗急性白血病化疗后骨髓抑制期的临床用药规律研究 [J]. 中
国医院用药评价与分析 ,2021,21(10):1250-1253+1257.
[10] 陈小舜 . 罗秀素辨治慢性粒细胞白血病的经验 [J].
浙江中医志 ,2000,9(06):237- 237.
[11] 网 络 药 理 学 评 价 方 法 指 南 [J]. 世 界 中 医
药 ,2021,16(4):527-532.
[12] 付海荣 , 庞毅 , 谭家华 , 等 . 山豆根治疗白血病作用
机制的网络药理学研究 [J]. 中国药房 ,2019,30(24):3392-3398.
[13] 朱章志,施岚尔,刘江涛,等 . 基于网络药理学探
索青蒿治疗人急性髓系白血病作用机制 [J]. 中华中医药学刊 ,
2021, 39(1):1-4.
[14] 郭 珮 , 冉 建 华 , 李 静 , 等. 注 射 用 核 糖 核 酸
II 上 调 P53 诱 导 人 白 血 病 细 胞 凋 亡 [J]. 中 国 药 理 学 通
报 ,2016,32(12):1729-1734.
[15] Zhu F, McCaw L, Spaner D E, et al. Targeting the IL-
17/IL-6 axis can alter growth of Chronic Lymphocytic Leukemia
in vivo/in vitro [J]. Leukemia research, 2018, 6(6):28-38.
[16] Finney Olivia C, Brakke Hannah M, Rawlings-Rhea
Stephanie, et.al. CD19 CAR T cell product and disease attributes
predict leukemia remission durability[J]. The Journal of Clinical In
vestigation,2019,129(5):2123-2132.